Музей возник на базе школьного музея, основанного учителем-энтузиастом М.Г.Елькиным. С 1948 по 1972 гг. учащиеся провели более 20 археологических, палеонтологических, геологических и других экспедиций по югу Кузбасса. На основе собранных коллекций в 1961 г. был открыт государственный музей. В коллекции музея археологические, палеонтологические, геологические, этнографические материалы, памятники истории города и района. Экспозиция включает отделы:

·                     Природа: «Развитие жизни на Земле», «Палеонтология юга Кузбасса», «Полезные ископаемые», «Растительный и животный мир», «Охрана природы»;

·                     Наш край в древности (от палеолита до позднего железного века): «Дегтяревская неолитическая стоянка», «Поселок Школьный», «Андроновская археологическая культура», «Курганные могильники»;

·                      Народы нашего края: «Комплекс шорца-охотника», «Быт и занятия телеутов», «Комплекс «Телеутская свадьба»;

·                     История края XVII – начало XX вв.: «Освоение края русскими (комплекс избы)», «Томский железоделательный завод (1774 – 1864 гг.)», «Геологические исследования (мемориальный комплекс геолога В.И. Яворского)»;

·                     Прокопьевский район в период революции и гражданской войны (1917 - 1920 гг.): оружие, документы партизан;

·                     История города 1920 – 1940 гг.: Комплекс «Штольня»; «Шахтерское строительство», «Стахановское движение», «Политические репрессии 1930-х гг.»;

·                     Прокопьевск в годы Великой Отечественной войны 1941 – 1945 гг.